1育雛期：育雛期是各種疾病的易發期，是飼養成敗的重要時期。在此時期導致雛鳥死亡的疾病主要是呼吸道感染。由于雛鳥對不良環境因素，特別是對潮濕和塵埃較敏感，往往由于空氣污濁，地面墊料潮濕，室溫過高或過低而誘發呼吸道感染，如曲霉菌病等出現一系列呼吸道癥狀，打噴嚏、咳嗽等，若發現及時，并采取適當措施消除誘因并使用抗生素治療，預后一般良好，否則可導致死亡。因而，在育雛期必須有專人管理，24小時值班，隨時注意雛鳥的精神狀態和采食情況，發現問題及時處理；育雛室的墊料須質地松軟，吸濕性好且不易產生塵埃，盡量減少應激因素的干擾。此外，應謝絕外來人員特別是其他禽場工作人員的參觀，以杜絕病原的入侵。
　　2育成期：這個時期鴕鳥生長快，日增重可超過05公斤。在此時期常發的疾病有前胃積沙病和軟腳病。
　　前胃積沙病　這是一種以吃進多量沙粒積塞在前胃內引起消化功能紊亂的疾病，可因營養不良導致心臟衰竭而死亡。其病因尚不清楚，可能與飼料中缺乏硒等某些微量元素有關。其主要癥狀表現為減食，隨之消瘦。如發展成廢食，則2～3天后便死亡，剖檢可見前胃內積滿沙粒，其重量多達4～5公斤。腸道粘膜充血。心肌萎縮、水腫，心臟脂肪消失。
　　本病可采取以下措施進行防治：①發病早期可實行限沙放牧，即在運動場上鋪上硬塑料板，避免鴕鳥與沙粒直接接觸。同時提高飼料質量，在飼料中添加硒等微量元素和多種維生素，并給予豐富的優質青料。②在常發、多發本病的鴕鳥場，每隔幾天于精料中添加一些輕瀉藥如石蠟油等，以促進體內多余的沙粒及時排出體外，達到預防本病發生的目的。③重癥病鴕可實行手術治療。這在汕頭已有手術治療獲得成功的經驗。
　　軟腳病　系由于生長過快，身體增重的速度超過雙腳骨骼的生長和骨質的鈣化速度，使雙腳超負荷負重引起的。此時，一方面要限制飼料的配給量以控制生長速度。另一方面，在精料中添加鈣磷等礦物質和維生素D等多種維生素，以促進骨骼的生長和骨質的鈣化。此外應核查一下運動場地是否足夠大以及飼養場的日光照情況。
　　3成鳥：成鳥有很強的抗病力。但這并不等于養殖鴕鳥對疫病可以置之不理。近年來，廣東佛山、江門、汕頭均從南非進口的種鳥和鳥蛋中檢出新城疫、禽白痢桿菌病和禽敗血霉形體病的抗體。說明鴕鳥已感染上述病原，只是成鳥未見臨診癥狀而已，其對鴕鳥的生產力是否構成損失未有直接資料數據(編注：國內某些場飼養的鴕鳥已有新城疫的發生，造成較嚴重的經濟損失)。隨著鴕鳥的圈養，飼養方式的改變，上述病原是否將對鴕鳥構成直接威脅尚難預料。盡管如此，筆者認為鴕鳥飼養者仍不可大意，做好疫病預防如謝絕不必要的參觀，飼養場門口設置消毒池等很有必要。
　　據飼養員反映，成鴕可發生難產。主要系因受驚或環境噪音如新建鴕鳥場或場附近正在基建時機器發出的噪音等。對本病的預防在于消除誘因，為鴕鳥提供一個安靜、空氣清新的環境。